在本次举行的第65回世界SF大会暨第46回日本SF大会上获奖的作品有：
日本长编部门：《日本沉没 第二部》小松左京&谷甲州
日本短编部门：《大风吕敷と蜘蛛の糸》野尻抱介
海外长编部门：“移动都市”
海外短编部门：“ワイオミング生まれの宇宙飞行士”
多媒体部门：“时をかける少女［穿越时空的少女］”细田守监督
漫画部门：“ヨコハマ买出し纪行［横滨购物纪行］”芦奈野ひとし
插画家部门：天野喜孝
特别赏：米泽嘉博(Comiket执行长，已故)
2006届“星云赏获赏情况”
细田守监督剧场版“穿越时空的少女”此次是从TVA《ZEGAPAIN》、TVA《凉宫春日的忧郁》(凉宫春日如今也算SF系了？)、今敏监督剧场版《帕布莉卡》、电影《日本以外全部沉没》这4个竞争对手之中胜出的。
漫画家芦奈野仁的经典作品《横滨购物纪行》一举夺下此届漫画星云赏，用实力证明了这部作品不仅在背景世界观上拥有细致的设定，故事内容更是蕴含著丰富哲学的思路。当然，其他候选作品：《和谐笔记本》、《武装炼金》、《魔偶马戏团》、《妖精国骑士》其独特的科学幻想氛围也是相当值得肯定的，但与正统的SF向作品仍然还是有一定距离。
